Ngày 4 tháng 2 năm 884, quyền thần Fujiwara no Mototsune lật đổ Thiên hoàng đang trị vì là Yōzei và đưa con trai thứ ba của Ninmyō, lúc này đang làm Thương thư Bộ Lễ[7] kiệm nhiêm Thống đốc tỉnh Hitachi lên ngôi vua.

Ngày 23/3/884, hoàng tử Tokiyatsu chính thức đăng quang ở tuổi 55[8], lấy hiệu là Thiên hoàng Koko và dùng lại niên hiệu Gangyō (877-885) của cháu mình, đổi thành Gangyō (884-885) nguyên niên.

Năm 885, ông đổi niên hiệu mới là Ninna (885-889)[9].

Triều đại của Koko được đánh dấu bằng sự phục hồi các lễ hội Nhật Bản, ông cũng phục hồi lại tục săn chim ưng vốn có từ thời Thiên hoàng Kanmu.

Tháng 2/886, Thiên hoàng Koko hay lui đến Seri-Gawa để đi săn chim ưng[10]. Ông rất thích loại này săn bắn, và ông thường mất nhiều thời gian cho loại hoạt động này.

Ngày 17 tháng 9 năm 887, Thiên hoàng Koko băng hà ở tuổi 57[11]. Con trai thứ ba của ông sẽ lên ngôi, hiệu là Thiên hoàng Uda.

Kugyō

• Quan bạch: Fujiwara no Mototsune (藤原基経) (Shōsen-Ko,昭宣公), 836-891.
• Thái Chính đại thần: Fujiwara no Mototsune.
• Tả đại thần: Minamoto no Tōru (源融).
• Hữu đại thần: Minamoto no Masaru (源多).
• Nội đại thần: (không chỉ định)
• Đại nạp ngôn: Fujiwara no Yoshiyo (藤原良世)
• Đại nạp ngôn: Fujiwara no Fuyuo (藤原冬緒)

Niên hiệu

• Gangyō (元慶 Nguyên Khánh) (877-885)
• Ninna (仁和 Nhân Hòa) (885-889)